Wisuda adalah upacara pengukuhan lulusan dan penyerahan ijazah yang dilaksanakan oleh Rektor, Dekan Fakultas dan Direktur Pascasarjana Universitas Mulawarman. Pelaksanaan wisuda Universitas Mulawarman diselenggarakan pada bulan Maret, Juni, September dan Desember dengan tetap memperhatikan situasi dan kondisi Pandemi Covid-19, sehingga menjadi pertimbangan apakah dilaksanakan secara luring atau daring.
Pelaksaan dan pendaftaran wisuda diselenggarakan oleh Bagian Akademik, Biro Akademik dan Kemahasiswaan Universitas Mulawarman, berkoordinasi dengan Fakultas, Pascasarjana, Biro Umum dan Keuangan, LP2M, LP3M, UPT. Bahasa, UPT. Perpustakaan, UPT. TIK, UPT. Perkasa, Badan Pengelola Usaha, IKA Unmul dan lembaga perbankan yang ditunjuk oleh Universitas Mulawarman sebagai penerima setoran biaya wisuda.